Last Updated on 04/10/2015
ضم بوادئ تفاعل الكوثرة المزوجDuplex PCR للكشف عن كميات دقيقة من DNA بكتريا Helicobacter pylori المعدية للعمل كعدة تشخيصية
المشاركون :
1- د. حسن محمود موسى ابو المعالي / جامعة كربلاء -كلية الصيدلة – فرع العلوم المختبرية السريرية
2- أ.د. زهرة محمود ناصر الخفاجي /جامعة بغداد -معهد الهندسة الوراثية و التقنيات الاحيائية للدراسات العليا
المشاركون :
1- د. حسن محمود موسى ابو المعالي / جامعة كربلاء -كلية الصيدلة – فرع العلوم المختبرية السريرية
2- أ.د. زهرة محمود ناصر الخفاجي /جامعة بغداد -معهد الهندسة الوراثية و التقنيات الاحيائية للدراسات العليا
المستخلص
لاجل تلافي حالة فشل تفاعل الكوثرة بسبب التغير في النيوكليوتيدات في مواضع ارتباط البوادئ بجزئيات DNA القالب ( الفحص السالب الخاطئ )و تاكيد وجود بكتريا الملويات البوابية ( Helicobacter pylori )المهمة طبيا في عينات الخزع المعدية بدقة عالية و كلفة مقبولة نسبيا و بطريقة سهلة , تم تحليل عدد من البوادئ لايجاد امكانية استعمالها في تفاعل الكوثرة المزدوج و قد وجد ان احد البوادئ الخاصة بتضخيم جين 16S ribosomal RNA لهذه البكتريا و كذلك احد البوادئ الخاصة بتضخيم جين(glmM (UreC. للبكتريا نفسها لهما القابلية في احداث تفاعل المزوج Duplex PCR سوية في ان واحد . و قد بنيت النتائج ان فحص الازدواج الذاتي و المتباين قد افضى الى درجات مسموح بها لاجراء تفاعل الكوثرة المتعدد و ان النتائج التجريبية اثبتت هذه الفرضية . و يستنتج من الدراسة الحالية ان الجمع بين هذين البادئين ملائم للكشف الدقيق عن وجود هذه البكتريا في عينات الخزع المعدية .
Duplex PCR primers for Detection of Helicobacter pylori DNA Directly from Gastric Biopsy Samples as a Diagnostic Kit
DR . Hassan Mohmood Mousa
Dr . Zahra Mahmood Nasser
Summary
In order to avoid PCR failure because of nucleotides variability in primers annealing sites in template DNA molecules , and confirmation the presence of a meically important bacteria Helicobacter pylori in the gastric biopsy samples with a high accuracy , with relatively low cost. So that , several primers pairs were analyzed for duplexing capacity. One for 16S ribosomal RNA gene,and one for glmM (UreC) gene of this bacterium have duplexing capacity. Those primers were designed separately to detect the presences of H. pylori with high efficiency. The dimerization analysis resulted in an allowable degree to use in duplex PCR and the laboratory results confirmed applicability of this hypothesis.The curent study confirmed that the combination of these two primers is suitable for accurately detection of these bacteria directly from gastric biopsy specimens.